一名员工在一年内由于频繁迟到，遭到了公司扣罚工资总计20余万元。该员工随后向劳动仲裁机构提出申诉，仲裁结果支持员工，要求公司补发工资差额。对此，公司表示不服并提起了诉讼。

案件中提到的江某自2019年9月起在一家医疗公司担任内勤和销售的双重职责，月薪构成为基本工资24000元加上内勤绩效6000元。公司考勤政策严格，明确规定未经许可的缺席、迟到早退或擅自离岗均视作旷工，并制定了相应的罚款措施，例如迟到多次将按旷工处理，每次旷工扣当月工资的8%。

从2020年11月30日至2021年11月30日，江某因上述考勤问题被累计扣除了209400元工资。对此不满，江某提起劳动仲裁，认为公司的罚款缺乏法律依据，并请求补回扣减的工资。仲裁结果偏向江某，裁定公司需补发相应工资差额。

公司不接受仲裁决定，转而向法院提起诉讼，请求维持扣款决定。然而，法院在审理后指出，尽管企业有权通过规章制度管理员工迟到行为并适度扣除工资，但这种管理应当合理、善意，不得滥用罚款权过度克扣工资。法院计算了江某的实际缺勤情况，认定其合理的工资扣减应为12781.90元，远低于公司实际扣除的金额。因此，判决公司需向江某返还工资差额196618.10元。

最终，双方当事人均未就一审判决提出上诉，意味着该判决成为了终局决定。