使用CRISPR使噬菌体对大肠杆菌更致命
丹麦SNIPR BIOME ApS的生物工程师团队与来自斯洛文尼亚卢布尔雅那AFRAL的一位同事和美国JMI实验室的另一位同事合作,开发了一种使用基因编辑工具CRISPR编辑病毒的方法,使噬菌体对一系列大肠杆菌(E. coli)细菌更致命。在他们的研究中,该小组使用基因编辑工具允许病毒靶向测试猪中的特定细菌。
在过去的几年中,医疗机构已经清楚地认识到,需要新型疗法来对抗细菌感染。除了细菌对已经开发的抗菌疗法产生更强的抵抗力的问题之外,还有涉及抗菌使用的刀耕火种方法的问题 - 它们不能仅用于目标细菌,因为它们肠道中的所有细菌,甚至是有益的菌株。
一种新方法涉及使用噬菌体,噬菌体是攻击和细菌的病毒。噬菌体必须被发现或创造。至少可以说,找到只攻击和目标细菌的噬菌体是困难的。因此,第二种选择已成为一个更严肃的研究目标。
噬菌体不能从头开始创建,当然,它们必须已经以另一种形式存在,并被改变以适应给定的需求。这种工程可以通过多种方式完成。在这项新的研究中,研究人员选择使用CRISPR基因编辑系统。他们首先筛选了162种噬菌体的属性,这些属性使它们更有可能感染某种细菌:大肠杆菌。最终,他们将这个数字减少到只有八个。然后,他们设计了每个噬菌体来携带编码基因编辑器的基因,以及用于靶向正确基因的RNA。然后,研究小组测试了噬菌体,看看它们在测试迷你猪中靶向和大肠杆菌的能力如何。
他们发现将几种工程噬菌体组合在一起是最有效的方法。他们将混合物命名为SNIPR001。在迷你猪中进行的测试表明,SNIPR001不会引起意想不到的问题,噬菌体也没有进入血液。然而,他们确实攻击并了大肠杆菌。SNIPR001目前正在进行临床试验。
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