生物医学数据科学培训获得新资助
莱斯大学生物医学信息学和数据科学NLM培训计划(NLMTP)已获得美国国立卫生研究院(NIH)下属的国家医学图书馆(NLM)的4万美元赠款。
这笔赠款代表了对30多年前开始的一项计划第七次支持,该计划旨在促进计算和生物科学研究人员之间的多学科培训。
经过竞争性审查后授予的多学科和多机构资助将每年支持八名博士生和五名博士后研究员,为期五年。这个独特的计划是全国仅有的18个计划之一。其他课程包括斯坦福大学、哈佛大学、耶鲁大学和哥伦比亚大学的课程。
墨西哥湾沿岸联盟(GCC)的Melissa Glueck负责管理培训计划,其中包括来自赖斯,贝勒医学院,休斯顿大学,休斯顿德克萨斯大学健康科学中心,德克萨斯大学MD安德森癌症中心和德克萨斯大学加尔维斯顿医学分部(UTMB)的教师。NLMTP是海湾合作委员会八个竞争性资助的培训项目中最大的一个。
“我们渴望培养一代能够跨越传统界限并能够为生物医学问题找到大胆解决方案的科学家,”自2015年以来担任NLMTP首席研究员兼项目主任的Lydia Kavraki说。她是诺亚·哈丁计算机科学教授,生物工程、机械工程、电气和计算机工程教授,以及赖斯肯尼迪研究所所长。
计划学员是通过竞争性申请流程选出的,并由两名具有互补专业知识的教职员工共同指导。博士生可以竞争长达三年的支持,博士后研究员可以竞争长达两年的支持。迄今为止,已向大约240名受训人员提供了支助。受训者及其双重导师来自六个NLMTP机构。
“这种新颖的指导安排,其中计算教员和生物医学科学教员或临床研究人员共同指导受训者,自NLMTP成立以来一直有助于NLMTP的成功,”Kavraki说。
对于到2027年的最新更新,已经聚集了46名核心教师,拥有强大的研究和联邦资金。他们共同指导了200多名博士生和130名博士后研究员。
“我们最大的优势是我们的指导结构以及我们的灵活性和单独帮助每个学员的意愿,”Kavraki说。“这些结合我们强大的学术课程,广泛的研究活动,设备齐全的实验室以及令人难以置信的教师和学生,提供了无与伦比的培训环境。
NLMTP随着时间的推移而具有战略意义。该计划被认为是计算生物学的培训,由已故的托尼·戈里(Tony Gorry)领导,他是赖斯的弗里德金管理和计算机科学教授。该计划包括计算,数据科学,应用数学,统计学,生物医学,建模,数据驱动的推理和决策,以及认知信息学的进步,以应对生物医学问题。
新资助的重点是生物医学信息学和数据科学及其与人工智能(包括机器学习)的动态相互作用,以及它们在生物医学和人类健康和疾病中的应用。
“生物医学信息学广泛包括设计和实施新的方法和技术,以解决整个生物学和医学领域的挑战性问题,”Kavraki说。“我们的培训计划强调定量方法和数据科学。如果没有计算机科学、统计学和数据科学的坚实基础,我无法想象未来处理生物医学问题。
该计划将支持医疗保健/临床信息学,转化生物信息学和临床研究信息学的研究。她说,这些领域推进了个性化医疗,并将数据和知识与健康和疾病联系起来。
该计划拥有许多成功的莱斯博士生和博士后校友。在最近的学员中,克里斯汀·彼得森是MD安德森生物统计学助理教授;Kevin Liu是密歇根州立大学计算机科学与工程助理教授;Sharon Chiang是加州大学旧金山分校的住院医师和研究员;丽莎·迈尔斯是赖斯大学计算机科学助理教学教授;Athanasios (Nasos) Dousis是Tessera Therapeutics的蛋白质和RNA工程总监;Raphael Rosengarten是计算精准医学公司Genialis Inc.的首席执行官。
“我为我们的学员感到最自豪,”Kavraki说。“他们吸收并结合了我们丰富的环境和他们的个人培训中的元素,并产生了真正出色的工作。
“NLMTP满足了对在定量科学和生物医学交叉领域接受过培训的研究人员的关键,不断增长的需求,他们可以解决生物医学信息学和人类健康和疾病中目前我们无法解决的问题,”赖斯研究副总裁Ramamoorthy Ramesh说。“该计划为赖斯大学和其他五个机构的博士生和博士后提供严格的培训。我们的NLMTP证明了我们联合社区的力量。
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