解锁癌症的祖先

知道你的祖先来自哪里会是更好的癌症治疗的关键吗?也许吧，但那把钥匙适合哪里?我们如何将癌症的祖先根源追溯到现代解决方案?

对于冷泉港实验室(CSHL)研究教授亚历山大·克拉斯尼茨(Alexander Krasnitz)来说，答案可能存在于包含数十万份肿瘤样本的庞大数据库和医院档案中。

Krasnitz和CSHL博士后研究员Pascal Belleau正在努力揭示癌症与种族或民族之间的家谱联系。他们开发了新的软件，可以从肿瘤DNA和RNA中准确推断血统。他们的工作还可以帮助临床医生制定早期癌症检测和个性化治疗的新策略。

“为什么不同种族和民族的人患上不同类型的癌症的患病率不同?”克拉斯尼茨说。“他们有不同的习惯，生活条件，暴露 - 各种社会和环境因素。但也可能有遗传成分。

Krasnitz的团队使用混合DNA图谱训练了他们的软件工具。他们从已知背景的癌性和无关的无癌症基因组中创建这些图谱。然后，他们测试了该软件与已知血统患者的胰腺癌、卵巢癌、乳腺癌和血癌标本的性能。该团队发现该软件将其杂交图谱与种群相匹配，准确率超过95%。

“我们有一个很好的模型可以建立，”克拉斯尼茨说。“但很少有人来自单一血统。在某种程度上，我们都是混合的。因此，现在我们正在努力更深入地研究，测试未知血统的肿瘤样本，揭示祖先混合物，并实现更多的区域特异性。具体程度如何?现在，想想西非而不是东非。

Krasnitz和Belleau最近加入了与Northwell Health和SUNY Downstate Medical Center合作的结直肠癌研究。该研究使他们能够探索结直肠癌如何根据特定种族或民族以不同的方式突变基因。他们希望进一步完善他们的软件，不仅推断出整个基因组的祖先，而且推断其中每个序列的祖先。

“如果我们能够识别出更易患不同癌症或其他侵袭性疾病的局部祖先，它可以帮助我们确定基因组中负责的特定部分并靶向治疗，”Belleau说。

一个简单的DNA拭子可以告诉你你来自哪里，以及你会遗传哪些疾病。将来，它还可能给你打败他们的手段。

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