机器学习有助于确定高级基因组编辑的成功与否

Wellcome Sanger研究所的研究人员开发了一种新工具，使用一种称为主要编辑的技术来预测成功将基因编辑的DNA序列插入细胞基因组的机会。

作为CRISPR-Cas9基因编辑技术的演变，主要编辑在治疗人类遗传疾病方面具有巨大的潜力，从癌症到囊性纤维化。但到目前为止，决定编辑成功的因素知之甚少。

这项研究发表在Nature Biotechnology上，使用主要编辑器评估了数千种不同的DNA序列引入基因组。然后，这些数据被用来训练机器学习算法，以帮助研究人员为给定的遗传缺陷设计最佳修复方案，这有望加快将主要编辑带入临床的努力。

CRISPR-Cas2012开发于9年，是第一个易于编程的基因编辑技术1.这些“分子剪刀”使研究人员能够在基因组中的任何位置切割DNA，以便删除，添加或改变DNA序列的部分。该技术已被用于研究哪些基因对从癌症到罕见疾病的各种疾病很重要，并开发修复或关闭有害突变或基因的治疗方法。

碱基编辑器是在CRISPR-Cas9上扩展的一项创新，被称为“分子铅笔”，因为它们能够替代DNA的单个碱基。2019年创建的最新基因编辑工具被称为主要编辑器。它们能够高精度地直接对基因组进行搜索和替换操作，因此被称为“分子文字处理器”。

这些技术的最终目的是纠正人们基因中的有害突变。2.超过16，000个小的缺失变异 - 其中少量DNA碱基已从基因组中移除 - 与疾病有因果关系。这包括囊性纤维化，其中70%的病例是由三个DNA碱基的缺失引起的。2022年，碱基编辑的T细胞成功用于治疗化疗和骨髓移植失败的患者白血病3.

在这项新研究中，Wellcome Sanger研究所的研究人员设计了3，604个DNA序列，长度在69到<>个DNA碱基之间。这些序列入到三种不同的人类细胞系中，在各种DNA修复环境中使用不同的原代编辑器递送系统4.一周后，对细胞进行基因组测序，看看编辑是否成功。

评估每个序列的插入效率或成功率，以确定每个编辑成功的共同因素。发现序列的长度是一个关键因素，所涉及的DNA修复机制的类型也是如此。

　　免责声明：本文由用户上传，与本网站立场无关。财经信息仅供读者参考，并不构成投资建议。投资者据此操作，风险自担。 如有侵权请联系删除！