使用肽代替DNA标记分子以加速药物发现

麻省理工学院的一个化学家团队发现，使用肽而不是DNA片段来标记小分子可以加快药物发现过程。他们的研究发表在《科学》杂志上。

开发治疗或治愈人类疾病的药物通常是一个漫长而昂贵的过程。很多时候，它始于化学家将具有已知特性的蛋白质暴露于大量小分子中，希望找到一种紧密结合的蛋白质。

该过程的一部分涉及事先标记小分子，以便在结合发生后识别它们。通常，这涉及使用DNA的短片段。然而，使用DNA的缺点是它的敏感性和与某些化学物质和催化剂的不相容性。在这项新的努力中，研究人员试图找到一种替代标签，以使寻找新药的工作更有效率。

在他们的搜索中，研究人员使用肽进行测试，因为已知它们在更广泛的条件下是有用的。他们还发现，他们能够通过使用质谱法加快解码过程。

为了使用肽作为标签，化学家首先使用树脂固定正在研究的小分子。这在小分子和氨基酸之间建立了联系。然后反复进行反应。为了创建一个文库，树脂被切成更小的部分，每个部分的处理方式不同。反应完成后，树脂重新组合并再次分裂以允许下一次运行。

这种方法允许以比目前使用DNA作为标签更快的速度测试大量小分子。在通过质谱仪确定可能的候选者后，研究人员使用软件将光谱转换为独特的肽序列。该团队还编写了一个Python程序来处理数据。

研究人员指出，除了加快寻找新药的过程外，用肽标签替换DNA标签还可以创建更长的标签串 - DNA只允许四个字母。另一方面，肽允许16。

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