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基因组研究阐明了棕熊在整个物种范围内的多样性

2023-02-22 19:04:28 来源: 用户:吕刚凡 

棕熊是世界上最大的陆生食肉动物之一。它们的特点是肩膀上有肌肉发达的驼峰,这使它们的前腿具有额外的力量。目前发现的所有十个棕熊亚种都分布在北美、欧洲、俄罗斯和亚洲。

它们的形状、栖息地和行为表现出极大的多样性。在发表在《通信生物学》上的一项基因组研究中,一个国际研究小组,包括来自美因河畔法兰克福的四名科学家,调查了棕熊的遗传多样性以及这种变异是如何以及何时出现的。在这样做的过程中,他们提出了棕熊(Ursus arctos)的第一个全面的种群基因组研究,并用它的例子来展示上一个冰河时代对当今物种多样性的影响。

北美灰熊可能是最著名的亚种,但棕熊也原产于欧亚,它们优先生活在(山地)寒冷的森林中。据估计,全世界约有200万只动物,其中一半以上被认为是俄罗斯本土动物。

棕熊在中世纪在整个欧洲都很常见;今天,只有大约17.000只动物生活在这里。栖息地破坏、偷猎和缺乏接受度促成了这种毁灭。虽然它们在德国被认为已经灭绝 - 除了2006年的“布鲁诺”等个体移民 - 但它们并未被国际自然及自然资源保护联盟(IUCN)列为全球濒危物种。

为了比较棕熊亚种,科学家们检查了整个范围内的128只棕熊的基因组。这些基因组中有95个是专门为这项研究解码的。目的是使用新的基因组分析方法来测试以前关于不同人群之间相似性和差异性的发现,并回答开放性问题。这还包括哪些历史因素导致了今天的分布以及各自的基因组特征。

“为了全面了解棕熊的种群结构和遗传多样性,我们检查并比较了具有不同遗传特征的基因组的各个区域,包括雌性和雄性个体的X或Y染色体。与将整个基因组作为单个实体进行分析相比,这为我们提供了新的、更复杂的见解。我们发现,由我们的遗传数据产生的种群结构在很大程度上与目前的亚种分类相匹配 - 但存在细微差异,“该研究的第一作者,Senckenberg生物多样性和气候研究中心的科学家Menno de Jong博士解释说。

例如,欧洲和俄罗斯西部的棕熊,包括乌拉尔山脉甚至西西伯利亚西部的熊,目前被认为是被称为欧亚棕熊(Ursus arctos arctos)的一个亚种。遗传分析支持这一细分,并证实尽管地理范围很大,但这些地区的所有熊确实属于同一个基因集群。

然而,就北美棕熊而言,研究人员遇到了一种与当前分类不符的特殊性。除了原产于阿拉斯加西南部海岸附近的科迪亚克岛的巨型科迪亚克熊(Ursus arctos middendorffi)外,北美的所有其他熊目前都被认为是一个亚种,即灰熊(Ursus arctos horribilis)。

然而,根据新的分析,原产于阿拉斯加西南部的阿拉斯加半岛棕熊(曾经被认为是一个亚种,Ursus arctos gyas)与灰熊明显不同,实际上与科迪亚克熊更相似。“一种可能的解释是,阿拉斯加半岛棕熊亚种需要复活。另一种解释是,阿拉斯加半岛棕熊和科迪亚克熊代表同一亚种的和岛屿种群,“德容说。

研究人员还能够确定,由于上一个冰河时代的地理条件,这些阿拉斯加半岛熊与堪察加熊(Ursus arctos beringianus)具有相同的共同祖先。俄罗斯远东半岛堪察加半岛和阿拉斯加半岛一直由白令陆桥连接,直到大约11,000年前,当时全球海平面远低于今天。

与此同时,阿拉斯加与美洲被巨大的冰盖隔开,覆盖了现在的加拿大。随着全球气温的上升和白令海峡的分离,物种混合或隔离的可能性再次发生变化。

“令人惊讶的是,我们可以从基因组数据中读取这些古老的迁徙,以了解上一个冰河时代如何影响物种。由于新的发现,必须重新考虑以前的方法和解释,“研究负责人Axel Janke解释道,他是Senckenberg和法兰克福歌德大学以及黑森州LOEWE罗意威转化生物多样性基因组学中心(LOEWE TBG)的比较基因组学教授。

“对生物体的基因组分析,例如我们在LOEWE罗意威TBG进行的基因组分析,揭示了对地球生物多样性及其进化历史的非常详细的新见解。基因组学还处于起步阶段,但已经证明自己是充分理解生命的未来技术,“Janke继续说道。解开棕熊人口历史的研究方法可以作为研究历史事件对许多其他物种影响的蓝图。

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