纠错机制对细胞非常重要,因为随着所有细胞活动的不断进行,故障一直在出现。但是当涉及到癌细胞时,诱导错误符合细胞的最佳利益。放疗和化疗可以通过破坏细胞的DNA来引起细胞缺陷。然而,一些肿瘤细胞具有非常有效的DNA修复机制,使它们能够逃避癌症治疗。
在Cell Reports上发表的一篇论文中,CNIO的Óscar Llorca,CNB的Fernando Moreno-Herrero和CIMA-Navarra大学的Puri Fortes现在揭示了这些非凡修复系统之一的工作原理:一种分子主食,首次使用新的纳米技术在起作用。
在预后最差的肝癌中
几年前,由Puri Fortes团队领导的一个研究小组发现,大约一半的肝细胞癌(最常见的肝癌类型)患者会产生一种名为NIHCOLE的RNA分子,该分子主要存在于最具侵袭性的肿瘤中,并且与预后不良有关。Fortes,Llorca和Moreno-Herrero得出结论,NIHCOLE在帮助修复断裂DNA方面非常有效,这就是为什么放射治疗在存在DNA的肿瘤中效果较差的原因。通过消除NIHCOLE,接受放疗治疗的癌细胞更容易死亡。
然而,NIHCOLE促进DNA断裂修复的分子机制尚不清楚。刚刚发表在Cell Reports上的论文对此进行了解释:NIHCOLE形成了一座桥梁,将断裂的DNA片段结合在一起。
“NIHCOLE同时与识别片段DNA两端的蛋白质相互作用,就好像将它们缝合在一起一样,”Llorca和Moreno-Herrero解释说。
了解这种机制可能有助于制定对抗预后最差的肝癌的策略。“使用NIHCOLE抑制剂药物可能代表一种针对最常见肝癌形式的新疗法,”研究人员说。
用于拉伸DNA的磁性纳米镊子
为了了解NIHCOLE的工作原理,Fernando Moreno-Herrero的小组使用了磁性镊子,这是一种纳米技术技术,可以研究单个分子的物理特性。
研究人员设计了一种模仿断裂DNA的DNA分子,使他们能够检测两个碎片末端之间的连接。首先,他们将千分之一毫米的微小磁珠附着在DNA的一端,然后使用磁性纳米镊子拉动该端。拉伸DNA的长度表明它是一个重组的DNA分子,其中DNA的断裂端已经连接在一起,或者它是否仍然断裂。
对于Cell Reports论文的作者来说,这些数据表明NIHCOLE“通过帮助肿瘤细胞修复DNA断裂来赋予它们优势,从而维持癌细胞的恶性增殖,尽管细胞分裂本身的压力导致DNA损伤的积累。
不再是垃圾的“垃圾DNA”
NIHCOLE 不是由基因合成的蛋白质,而是一种 RNA 分子。这是二十年前生物学家称之为垃圾DNA的一部分,当时人类基因组正在测序。当时,他们错误地认为这种DNA是无用的。
Llorca解释说:“生物学的核心教条之一是DNA中每个基因中包含的信息被翻译成蛋白质。因此,当科学家们发现我们只有 2% 的 DNA 含有基因时,他们感到震惊;我们基因组的其余部分是干什么用的?不可想象的是,98%的基因组是垃圾的、无用的DNA。在过去的十年中,已经表明,这种黑暗基因组的一部分产生非常长的RNA分子,其中一些在癌症中具有普遍的功能。
NIHCOLE是这些长RNA分子之一,其存在和功能直到最近才被发现,以至于生物学家仍然感到惊讶。同样令人惊讶的是,只需要一小块NIHCOLE即可作为分子主食。
“这将允许开发阻断或扭曲这种结构的药物,从而提高癌症患者放疗或化疗的疗效,”该论文的作者说。