来自密歇根州立大学、印第安纳大学、俄亥俄州立大学和杜兰大学的一组研究人员对同基因人类非转移性和转移性结直肠癌细胞系进行了自上而下的蛋白质组学研究。

在他们发表在《科学进展》杂志上的论文中，该小组描述了他们如何使用 TopPIC 分析软件和电泳-串联质谱法分析来自结直肠癌细胞的细胞系中的蛋白质，以及他们这样做的发现。

先前的研究表明，癌症的问题通常不是癌性肿瘤的发展;相反，当它们转移时，就会出现严重的问题。正因为如此，医学研究人员一直在寻找可以检查的标记物，以确定特定患者是否不仅患有特定类型的癌症，而且是否已经转移。

在这项新的努力中，研究人员开发并实施了一种自上而下的方法来研究与转移性和非转移性结直肠癌的发展相关的蛋白质及其作为疾病标志物的可能用途。

研究人员的工作涉及使用名为 TopPIC 的软件产品分析数千种蛋白质和蛋白质形式(一种特定类型的蛋白质)，寻找与结直肠癌的关联。他们还怀着同样的目标进行了质谱研究。该团队使用的独特方法使他们能够直接测量仍然完好无损的蛋白质组，从而可以研究它们的特定功能。

总之，该团队分析了 23,622 种蛋白质形式和 2,332 种蛋白质，并在此过程中发现他们能够查明可用于区分结直肠癌转移形式的变体。他们还能够识别出大约 17,300 种与非转移性结直肠癌相关的蛋白质形式。研究人员还发现，这两种细胞系都具有与某些类型的信号和酶相对应的蛋白质形式。

研究人员得出结论，表明他们的工作清楚地证明了来自转移性和非转移性结直肠癌的细胞系具有非常不同的蛋白质形态特征。他们进一步表示，这些概况可能代表生物标志物，有朝一日可能会在针对它们开发的新型测试中寻找这些生物标志物，作为结直肠癌测试的一部分。